昔年红云老祖在紫霄宫中听讲时曾因让出了蒲团，与妖族的鲲鹏结下因果。

后为了报复红云，鲲鹏唆使帝俊太一出手截杀红云，为了得到鸿蒙紫气，帝俊太一与鲲鹏三人联手围攻红云。

红云无奈自爆肉身，以九九散魄葫芦裹着残魂遁入地底逃走，经过血海时，又惨遭冥河截击，仅剩一缕残魂在九幽之地夹缝生存。

就这样不知过了多久，后土身化轮回，红云的残魂也得以来到了幽冥之地，只可惜他的残魂力量太弱，无法进入轮回之中。

太清老子自分得一个皇位后，每日以太极图推演，终于算出了地皇与红云之间的关联。

他得知红云卡在六道轮回前，想到昔年巫妖大战时，妖族为了炼制屠巫剑大肆屠戮人族，人族曾受镇元子庇护，结下莫大因果。

于是动身前往五庄观，与镇元子商议，以助力红云入轮回为条件，与镇元子了断昔年因果。

镇元子骤然听闻自己的好友还有转世轮回的机会，自然是十分高兴，当即答应下来。

待红云成功进入轮回之后，玄都大法师走出首阳山八景宫，将神农收做弟子，悉心教导。

伏羲功德圆满，神农氏继任人族共主之位后，带领人族大力发展农耕文明，种植五谷杂粮，让人族从此过上了自给自足的生活。

然而人族天生力弱，虽有伏羲发明的八卦可以趋吉避凶，但在面对疾病的时候，还是显得十分无力。

一旦感染疾病，没有得到任何的治疗，一些体质较弱的族人只能在绝望中死去。

神农氏见到此幕，心中暗自神伤，他开始尝试遇到了每一种灵草，用自己的身体，去记录每一种草药的药性与功效。

这些草药中，有能治疗疾病的灵药，也有带着剧毒，足以使人毙命的毒药，神农几次经历生死，即便在人族气运的守护下，也是险象环生。

他数十年如一日的在洪荒各处探寻，终于制成了一部药典，并取名《神农本草经》。

在人族地皇神农距离自己功德圆满之日越来越近的时候，玄陈山脉中，陈玄的修行也到了至关重要的时刻。